利用基因组挖掘技术研究星海链霉菌的生物合成潜能

摘要

本实验室在前期研究中分离鉴定了一株新的海洋放线菌，命名为星海链霉菌并进行了全基因组测序。通过比对分析，预测了4个NRPS合成基因簇以及4个PKS类化合物生物合成基因簇。其中，通过一个相似度达到86%的卤化酶sinH,确定了一个与某具抗补体活性的糖肽类化合物生物合成基因簇相似的基因簇，其总长度约51kb，含有18个基因，且各基因与己知糖肽类化合物的合成基因簇相应基因具有60%到80%相似度。RT-PCR分析结果表明，该基因簇中多个基因的表达为阳性，证明该基因簇在所使用的培养条件下是活化状态，发酵液粗提物检测到较强的抗补体活性，目前该基因簇的基因功能分析正在进行中。