烯萜合酶基因的生物信息学分析

摘要

萜类化合物是花香物质非常重要的一类,GPP在不同烯萜合酶(terpene synthase,TPS)的作用下形成不同的萜类化合物.根据GenBank上已登录的百合、牛至栽培种、猕猴桃、百里香、TPS的蛋白质氨基酸残基序列,应用生物软件对以'西伯利亚'百合(Lilium'Siberia')为研究重点的4种植物TPS基因核苷酸序列以及对应的氨基酸序列的理化性质、疏水性与亲水性、导肽、跨膜区域和二级结构进行分析,其功能结构域及高级结构等进行预测和分析.得到如下结果:4种植物的TPS不具有信号肽和导肽,不存在跨膜结构,推测TPS蛋白可能定位于细胞质中发挥功能,多肽链总体表现为亲水性;二级结构的主要结构元件是α-螺旋、无规则卷曲、β-转角和延伸链,均以α-螺旋为最主要的结构元件;4种植物TPS蛋白均具有高度保守的结构域Terpene_synth和Terpene_synth_C.有助于从基因和代谢等方面研究植物特定性状的遗传改良，为最终获得具较强观赏性、较佳实用性的植物新品种作出积极的贡献。