柴胡属药用植物DNA条形码研究

摘要

为评价DNA条形码候选序列对柴胡属药用植物的鉴定作用,探讨柴胡属药用植物鉴定的新方法,本研究对柴胡属19个物种,51份样品的四个候选条形码序列(psbA-tmH,mark,rbcl,ITS2)进行PCR扩增、测序和序列分析,比较各序列扩增和测序效率、种内和种间变异,进行barcoding gap分析,采用BLAST1和Nearest Distance方法评价不同的序列的鉴定能力.结果显示,ITS2在所研究的柴胡属药用植物中的扩增和测序效率均为100％,其种内种间变异、barcoding gap与其他DNA候选条形码序列比较具有较明显的优势.ITS2序列在柴胡属中的鉴定成功率为73.68％,与psbA-trnH联用后鉴定能力达到了83.33％.本文推荐将ITS2作为柴胡属药用植物潜在的DNA条形码序列,并联合psbA-trnH建立该属药用植物的DNA条形码鉴定方法.