小麦盐胁迫相关LncRNA的预测与分析

摘要

以耐盐种质小偃60和感盐种质鲁麦21为材料,利用高通量测序(Hiseq)和生物信息技术分析2种质在200mmol/L NaC1胁迫3h、12h和24h后相关LncRNA及其靶标的表达情况.结果表明,分别鉴定出519个上调和544个下调LncRNA.随盐胁迫时间增加,小偃60差异表达LncRNA数量逐渐增加,鲁麦21先增加后减少,3个时间段耐盐种质的差异表达LncRNA均大于敏感种质.结合耐盐路径,鉴定出小偃60和鲁麦21盐胁迫相关上调LncRNA.这些LncRNA与盐胁迫相关蛋白、酶类等的合成相关,在路径中表现为相对特异性,可通过多种LncRNA共同作用于路径中的靶基因.这些LncRNA可能与冬小麦耐盐性相关,可为冬小麦耐盐性鉴定提供参考.