利用SNP分子标记分析化橘红种质资源

摘要

本研究利用高分辨率熔解曲线(High resolution melting,HRM)方法对21份化橘红及3份近缘种质蜜柚和黄皮的25个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点进行了基因分型.结果表明,所有样品在其中21个SNP位点表现出较好的多态性,共呈现出11种基因型,其中化橘红基因型有9种,SNP位点平均杂合度为0.3631,多样性信息含量(PIC)平均值为0.2663;21个SNP位点可将24份样本分为3类,化州橘红种质单独聚为一类,表明SNP分子标记将成为化州橘红种质资源评价及品种鉴定的一项重要工具.另外,化橘红种质资源可能存在更多的品系,而不止是当前认为的"正毛"、"密叶正毛"、"副毛"、"光青"、"假西洋"、"黄龙"6个品系,且化橘红种质资源存在着同名异物和同物异名的现象.本研究为化橘红种质资源鉴定提供了有效的方法和依据,应用前景广阔.