不同鸡品种BNK基因序列比较分析

摘要

BNK(C-type lectin-like receptor2)基因为C型凝结素受体基因中的抑制性基因,与禽类先天免疫性能关系密切.本研究以NCBI中Gallus gallus BNK基因序列为参考,利用MEGA6软件对24个鸡品种的BNK基因进行序列比较分析,筛选出外显子和内含子上的SNPs位点、Indels以及氨基酸变化,并对24个鸡品种进行系统聚类.研究发现,SNPs位点大多发生在Exon3、Exon5和Exon6上,且多为错义突变.内含子上的SNPs位点大多发生在Intron1、Intron2和Intron4上.插入缺失发生在Intron2、Intron4和Exon5上,并且大多数品种Indels序列基本一致,国内外鸡品种之间并无显著差异.系统聚类分析将这些鸡品种分为3类,狼山鸡、罗斯鸡、隠性白羽肉鸡、茶花鸡和如皋黄鸡为一类;其次,雪山鸡、安卡鸡、斗鸡和萧山鸡聚为一类;固始鸡单独为一类,表明固始鸡的BNK基因为单独起源.综上表明BNK基因,尤其在中国地方鸡品种中具有丰富的遗传多样性,与不同鸡品种的先天免疫性能存在关联,这为家禽的免疫遗传学和抗病育种提供参考依据.