姜花中转录抑制因子HcJAZ1和HcJAZ2的克隆与功能信息学分析

摘要

以白姜花(Hedychium coronarium)为材料,利用RT-PCR技术克隆得到两个JA途径的转录抑制因子JAZ(Jasmonate ZIM-domain)基因,HcJAZ1和HcJAZ2.HcJAZ1基因全长1238bp,具有完整的开放阅读框708bp,编码235个氨基酸,预测分子量为25.7kDa,等电点(pI)为9.26.HcJAZ2基因全长1505bp,具有完整的开放阅读框780bp,编码259个氨基酸,预测分子量为28.5kDa,等电点(pI)为7.62.蛋白家族结构域分析显示HcJAZ1和HcJAZ2蛋白序列均含有和JAZs形成同源或者异源二聚体相关的高度保守的TIFY(又称ZIM)结构域,以及和泛素化降解,核定位相关的CCT_1(又称Jas)结构域.氨基酸同源序列比对结果表明不同的JAZ基因氨基酸序列的变化较小.聚类分析进化树结果表明,HcJAZ1和HcJAZ2与拟南芥的JAZ1和AtJAZ2亲缘关系相对最近,且具有较高的同源性.核定位信号分析预测结果显示HcJAZ1和HcJAZ2均在N端存在一段潜在核定位信号,NLS预测值分别为3.4和3.1.蛋白疏水性预测分析结果表明HcJAZ1,HcJAZ2均有较强的疏水性.二级结构预测分析结果显示HcJAZ1含有68.5％成α螺旋残基,37.9％成B折叠残基,15.7％成B转角残基;HcJAZ2含有56.9％成α螺旋残基,41.9％成β折叠残基,17.7％成B转角残基,这和AtJAZ1,AtJAZ2的二级结构表现出较高的相似性.此外,蛋白三维建模分析显示TIFY结构域和CCT_1结构域的空间位置关系在HcJAZ1和HcJAZ2中较为相似.