利用高通量测序技术研究中国红豆杉枝条转录组

摘要

紫杉醇是从红豆杉树皮中分离到的二萜化合物,它对乳腺癌、卵巢癌等具有显著的疗效,应用相当广泛.令人遗憾的是红豆杉生长缓满,资源量有限,特别是紫杉醇含量低,资源与开发矛盾突出.研究紫杉醇生物合成途径中有关基因及其调控机理对于提高红豆杉枝叶和培养细胞中紫杉醇产量都有重要意义.本试验利用高通量测序技术对中国红豆杉(Taxuschinesis)枝条的转录组进行了分析,找到了紫杉醇生物合成途径中几乎所有的已知基因. 我们还发现了其他P450基因Scaffold 77个和NADH dehydxogenase基因Scaffold 2个.除了这些结构调基因外,我们还发现了19个MYB transcription factor基因Scaffold、3个MYC基因Scaffold、8个AP2 domain-containing transcription factor基因Scaffold和6个Ethylene-responsive transcription factor基因Scaffold,这些结构基因和调节基因的Scaffold是今后对紫杉醇生物合成进行有效调控的重要资源.