利用高通量测序技术研究猪不同发育阶段的microRNA转录组

摘要

micmRNAs(miRNAs)是一类在生物体内新近发现的长度约为22 nt左右的非编码单链RNA，它在转录后水平对基因功能发挥调控作用。猪是人类重要的动物蛋白来源和生物医学模型，和其他模式动物相比，猪的miRNA组学研究明显滞后。本研究利用高通量测序技术对30胚龄到180日龄间的10个发育阶段的混合组织小RNA文库进行了测定。基于已知的哺乳动物的miRNAs序列信息，猪的全基因组序列(Scrotla9，April 2009)和EST信息为基础，发现了867个猪miRNA前体(其中623个具有基因组位置)，这些前体编码1，004个成熟miRNA，其中777个miRNA是特异的。本研究结果为猪的miRNA相关研究提供了宝贵基础数据。