应用巢式PCR检测鸭圆环病毒浙江株及其全基因序列分析

摘要

应用巢式PCR(nested PCR)技术对收集自浙江温州种番鸭进行鸭圆环病毒核酸扩增，并对测定的序列进行分析，结果用套式引物扩增出目的条带片段大小约为340nt。根据序列测定结果设计一对反向引物用于测定病毒基因组余下的基因片段。序列分析表明该圆环病毒基因组全长为1995nt，其ORF-V1编码292个氨基酸，其ORF-C1编码257个氨基酸。序列分析表明，本实验株与番鸭分离株(GenBank登录号EF451157)和半番鸭分离株(GenBank登录号EU344804)的同源性最高，均高达99.2％，和鸭圆环病毒欧洲(德国)分离株和北美(美国)分离株在同一支遗传进化关系上。