侵染广西甘蔗的高粱花叶病毒分子鉴定初报

摘要

在南宁市郊采到一份表现褪绿条纹、花叶的糖蔗(桂糖95-53)样品(编号为SC-NN1),经差速离心和PEG二次沉淀法提取病毒租汁液,电镜观察该病毒为略弯曲的线状,ELISA检测显示该病毒与甘蔗花叶病毒(Sugarcane mosaic virus,SCMV)、高粱花叶病毒(Sorghum mosaic virus,SrMV)多克隆抗血清呈阳性反应,与SCMV单克隆抗血清呈阴性反应,初步判断分离物为SrMV。针对SrMV CP 基因设计特异引物,利用RT-PCR和免疫捕获反转录PCR(Immunocapture reverse transcript PCR,IC-RT-PCR)对SC-NN1进行分子检测鉴定,两种方法均扩增出1条长约1.1kb的片段,而健康对照未扩增到任何片段。扩增片段经克隆后测序,序列包含1010个核苷酸,测序结果在NCBI上用BLAST进行同源性分析,该序列与SrMV浙江、云南分离物对应的核苷酸序列同源性大于95.32%,氨基酸序列同源性大于97%,根据马铃薯Y病毒科(Potyviridae)病毒种和株系的划分标准,将SC-NN1鉴定为SrMV.