猪源副粘病毒全基因组克隆及特性分析

摘要

将本实验室分离保存的猪源副粘病毒JL-1株.提取病毒基因组RNA.参考GenBank发表的相关禽副粘病毒Ⅰ型(Avian paramyxovirus serotype 1,APMV-1)基因组序列,设计了8对特异性引物,RT-PCR法分别特异性的扩增出病毒各基因片段,并将各目的基因片段回收纯化,将纯化后的PCR产物送到上海生工生物工程技术服务有限公司进行测序.测定结果得到NP、P、M、F、HN、La、Lb、Lc 8段基因序列,利用DANMAN软件进行拼接得到基因组全长cDNA序列(GcnBank登录号:EU546165).序列分析结果表明,PPMV IJ-1株与各地代表株核苷酸同源性87.85%～99.78%,与鹅源新城疫(GPMV)ZJ-1、NA-1株核苷酸同源性分别为83.31%,83.46%,同时根据各毒株F基因开放阅读框前389个核苷酸序列绘制出系统发育进化树,结果表明PPMV JL-1株与LaSota同属于基因Ⅱ型,不同于基因Ⅶ型的ZJ-1和NA-1株的鹅源毒株.