狐貉源犬瘟热病毒融合蛋白基因的克隆及序列分析

摘要

2004-2006年从黑龙江省和内蒙等地发病饲养狐、貉中分离获得6株犬瘟热病毒(CDV),分别命名为MS01、SC01、ZD01、GN01、HL01、NM01分离株.根据Genbank上发表的的CDVF基因序列设计了1对特异性引物,应用RT-PCR方法分别对6个分离株F基因进行克隆、测序,并推导其氨基酸序列,绘制出F基因的遗传进化树.结果表明6个CDV分离株F基因的开放阅读框架(ORF)均为1989bp,编码663个氨基酸,蛋白结构中的13个Cys残基位点和4个潜在的糖基化位点。均高度保守,其裂解位点的氨基酸序列为220R-R-Q-R-224R.遗传进化分析表明,6个分离株与CDV代表强毒株A75/17属于同一谱系,均为强毒株.其中HL01株与海豹瘟热病毒2型(PDV-2)亲缘关系较近,与其它5个分离株关系相对较远.