鹅源新城疫病毒JG97株融合蛋白基因的克隆与序列分析

摘要

本研究对鹅源新城疫病毒(NDV)JG97株的融合蛋白(F)基因进行了扩增、克隆和序列分析。根据GenBank中公开的NDV基因序列合成了一对引物,通过RT-PCR扩增出了JG97株的F基因。将扩增片段克隆到pGEM-T载体中,并进行了序列测定和分析。结果表明,该片段含一个完整的、长1662bp的F基因开放阅读框(ORF),编码的F蛋白长553个氨基酸,其中含有12个半胱氨酸残基和6个潜在的糖基化位点,其裂解位点的氨基酸顺序为<'u2>R-R-Q-K-R-F117,与NDV强毒株特征相符。与13个参考毒株的F基因同源性分析结果表明,JG97株与LZ-NDV、NA-1、SF02、Taiwan95和YG97株的核苷酸和蛋白氨基酸的同源性分别为94.6％～99.6％和96.6％～99.5％,与La Sota株的核苷酸和氨基酸的同源性仅为84.6％和88.8％。结果表明JG97株与LZ-NDV、NA-1、SF02、Taiwan95和YG97等5个毒株的遗传关系较近,而与La Sota株差异较大。