PPARy受体蛋白三维结构和配体结合位点的预测

摘要

目的:以过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)蛋白的氨基酸序列为基础,预测其三维结构与配体结合位点.方法:运用生物信息学方法及手段对PPARγ蛋白的二级结构和表面特性,如亲水性、理化性质、可及性、模体、跨膜区、信号肽和可塑性等方面进行分析,预测其配体结合位点.结论:应用多参数预测PPARγ蛋白的二级结构及配体结合位点,为进一步通过试验方法确定其优势位点和从结构出发了解其生物学功能,提供理论依据.