皖南黑猪H-FABP基因5'-上游区和第二内含子的多态性分析及克隆测序

摘要

本文对皖南黑猪心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因5'-上游区和第二内含子的多态性分析及克隆测序,为开展皖南黑猪肉质性状分子育种奠定理论基础;采用PCR-RFLP(HinfⅠ、HaeⅢ、MspⅠ3种限制性内切酶)分子标记技术,分析了184头皖南黑猪H-FABP基因5'-上游区和第二内含子区的遗传变异情况,并对该基因的多态片段进行克隆和测序分析;(1)在5'-上游区:HinfI位点上存在多态性,等位基因H的基因频率为0.62,表现为中度多态(PIC=0.3596);第二内含子区:HaelⅢ位点上存在多态性,等位基因D的基因频率为0.92,表现为低度多态(PIC=0.1307);而MspⅠ位点上尚未检测到多态,基因型均为AA型;HinfⅠ*位点上也存在多态性,等位基因B的基因频率为0.78,表现为中度多态(PIC=0.2824);(2)x2检验表明,除5'-上游区HinfⅠ多态位点外,其他3个位点均达到Hardy-Weinberg平衡状态(p＞0.05).(3)对H-FABP基因3个多态片段进行克隆测序分析发现,HinfⅠ-RFLP是由于1324bp处存在T→C的突变引起,HaeⅢ-RFLP是由于1811bp处存在C→G的突变引起,HinfⅠ*-RFLP是由于1970bp处存在C→T的突变引起;本试验确证了皖南黑猪H-FABP基因5'-上游区的多态位点并在第二内含子区检测到了HaeⅢ和Hinf*Ⅰ多态位点,这为进一步分析H-FABP基因不同基因型与IMF含量的关系,确定影响IMF沉积的主效基因提供一定的数据基础。