正红菇菌根围土壤真菌群落多样性

摘要

以正红菇(Russula griseocarnosa)菌根围土壤为研究对象,通过提取土壤基因组DNA,以通用引物扩增真菌18S rRNA基因V1+V2区,将PCR产物进行变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis,DGGE),获得土壤微生物群落的DNA特征指纹图谱,并对图谱中的优势条带回收测序,通过Blast进行同源性比对并构建系统发育树,进而分析正红菇菌根围真菌群落组成及多样性.同源性比对结果表明,在回收测序的19条DGGE条带中,4条为非真菌真核生物序列,系统发育分析显示全部序列可以分为4类菌群,Group Ⅰ主要为担子菌门(Basidiomycota)真菌,Group Ⅱ主要为子囊菌门(Ascomycota)真菌.GroupⅢ为未知真菌.GroupⅣ主要为节肢动物门生物(Arthropoda).