TD70/Kasalath RILs群体检测水稻穗部主要性状位点

摘要

水稻穗部是贮存光合作用产物的主要场所,是形成经济产量的主要部位.穗部形态也是株型育种的重要研究内容.水稻穗部性状主要包括穗长、枝梗数和每穗总粒数等,它们是构成稻穗的"基本骨架",是影响谷粒产量的重要性状.近年来已有许多关于穗部性状的QTL定位和研究.水稻穗部性状相关的一些重要基因已经相继被定位和克隆,如水稻籽粒数目有关的基因Gnla,控制水稻密穗直立及每穗粒数的多效基因DEP1、DEP3,控制水稻株高、抽穗期和每穗粒数的基因Ghd7,控制每穗颖花数QTL spp1,qSSP7,控制粒数的主效QTL qGN4-1,进一步开展穗型性状的遗传研究,挖掘新的穗型性状位点.本研究利用穗部性状存在明显差异的粳稻TD70和籼稻品种Kasalath杂交,经单粒传法获得的240个重组自交系(RILs)为作图群体,分别于2010年和2011年对穗长、每穗总粒数和着粒密度进行鉴定,用完备区间作图法,以均匀分布于12条染色体的141个SSR标记对粒型性状进行QTL检测.第2染色体的RM5699-RM424、第3染色体的RM489-RM1278、第4染色体的RM3367-RM1018和第6染色体的RM3343-RM412区间，都检测到同时影响每穗总粒数、着粒密度的QTL，两年均被检测到的QTL共有6个，分别是控制穗长的qPL3、每穗总粒数的qTSP4,qTSP6-2,qTSP7、着粒密度的qGD3-2,qGD7。其中qPL3,qTSP6-2,qGD3-2和qGD7为主效QTL。除穗长性状5个位点均有报道外，其余2个性状中均发现新的位点，共有16个QTL可能是新的位点，单个QTL贡献率为4%～9.5%。本研究为进一步精细定位或克隆这些粒型QTL奠定了基础。