我国6省市8地点大白菜根肿菌Pr01基因的序列多样性分析

摘要

不同地区的芸薹根肿菌(PlasmodiophorabrassicaeWoron.)对寄主植物的致病性存在广泛的差异,根肿菌内Pro1基因编码的丝氨酸蛋白酶Pro1蛋白具有刺激休眠孢子萌发的功能.为研究中国根肿菌致病相关基因,以采集自中国6省市8个地点的根肿菌分离物为试材,对Pro1基因进行PCR扩增、测序及序列分析.结果表明8个不同地点根肿菌Pro1基因序列之间共存在86处SNP变异;基于这些变异将这8个根肿菌分为三种类型,河南新野(XY)、广西南宁(NN)、山东青岛(QD)、辽宁沈阳(SY)为第一类,云南嵩明(SM)、云南通海(TH)、湖北长阳(CY)为第二类,河南原阳(YY)为第三类.研究结果为深入了解Pro1基因的进化和变异提供参考,同时也为进一步开发Pro1基因特异分子标记并利用分子标记对根肿菌进行科学分类奠定理论基础.