茶树谷氨酸脱羧酶家族(CsGADs)基因克隆及蛋白功能预测

摘要

为了研究茶树中谷氨酸脱羧酶基因家族对茶树GABA合成的作用效应,本研究利用RACE技术对茶树中GAD基因家族中的两个成员CsGAD2和CsGAD3的CDS区进行克隆,并利用生物信息学软件和在线数据库对茶树CsGAD2和CsGAD3进行蛋白结构分析与功能预测.RACE克隆得到CsGAD2的cDNA长度为1872bp,开放阅读框全长为1,539bp,共编码512个氨基酸;CsGAD3的cDNA序列为1,833bp,开放阅读框长1,482bp,共编码493个氨基酸.生物信息学分析表明,CsGAD2、CsGAD3编码的蛋白分子量分别是58,027.0Da、55,757.20Da,都是细胞质蛋白,具有亲水性,不存在明显跨膜区域,二级结构中无规则卷曲是主要的结构元件.CsGAD2在C末端氨基酸序列与CsGAD3不同,缺少色氨酸,推测CsGAD2可能不结合CaM.