甜菜黑色焦枯病毒及其卫星RNA侵染本生烟的小分子RNA分析

摘要

本研究对BBSV及其卫星RNA侵染的本生烟中small RNAs进行了高通量的测序和分析验证，结果表明，病毒的侵染导致了植物中small RNAs的长度分布和来源比例发生较大改变。进一步对病毒来源的vsiRNA的分析显示：BBSV来源的vsiRNAs正、负义链比例接近，5′端核苷酸以U为主；而satRNA来源的siRNAs正义链比例占90%以上，远高于其负义链，5′端核苷酸以A为主，并且在satRNA基因组正义链nt380-430区域存在一个非常明显的vsiRNA基因组分布热点。由此表明，BBSV和satRNA具有不同的正负义链比例、5’端核苷酸偏好和基因组分布，预示着二者可能具有不同的基因沉默降解方式。同时，分析结果显示：在不同致病力BBSV侵染的植株中，vsiRNA在病毒基因组上的分布存在差别，并且分布差异与病毒基因组序列的差异相关；在不同的侵染温度下，植物的miRNAs针对病毒的侵染也表现出不同的表达特征。