家养野猪源流行性腹泻病毒的分子鉴定及其S1基因的遗传变异分析

摘要

采用RT-PCR方法对河南省某猪场送检的家养野猪病料进行检测,表明其病原为猪流行性腹泻病毒(PEDV),命名为JZ0801,并对其S1基因克隆后进行序列比较和遗传变异分析.结果显示:JZ0801与PEDV参考毒株的核苷酸序列同源性为86.8％～99.0％,与疫苗株CV777的核苷酸同源性仅为87.1％; PEDV可分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ群,2011年后流行的PEDV主要分布在Ⅰ群和Ⅱ群;JZ0801分布于Ⅰ群,与国内猪源分离株HN6-201211和HBMC2012亲缘关系最近,而与日本、韩国毒株在遗传关系上关系较远.研究结果证实,家养野猪源PEDV与目前我国各地流行PEDV的主要类群相一致;PEDV可感染家养野猪并发病,提醒在进行野生动物养殖活动中要充分考虑疫病传播的生态学;PEDV存在较大的地域差异.