人源甲型H1N1流感病毒变异规律分析(2009.3-2009.8)

摘要

为了探究人源甲型H1N1流感病毒的变异规律,本文提出了一种图形化表达病毒序列的方法,该方法首先将甲型H1N1流感病毒HA基因的符号序列数字化表达,利用主成分分析(PCA)将高维数值序列的维度大幅度降低为二维,将低维的数值序列图形化表达在平面和空间中.在序列的图形化表达基础上,对2009年3月到8月收集的三千多个流感病毒样本做了新旧病毒的区分,筛选出了新型病毒菌株,并根据图形探究了甲型H1N1流感病毒在时间序列上的进化特征,从而进一步证实了方法的可靠性.