圆盘菌属无性型真菌的DNA条形码研究

摘要

捕食线虫丝孢菌是子囊菌中的一个食肉类群,其菌丝体可变态为各种结构精巧的捕食器官捕食线虫,在生物防治和进化上极具研究潜力.但分子证据和物种界定标准的缺乏,对其分类、科学命名和多样性研究造成了极大障碍.本研究选用了174个己发表的菌株，包含了4个属，72个种，选择真菌系统学研究中常用的基因片段ITS,RPB2,EF1a,R-tubulin,SSU及线粒体基因mtLSU等6个作为候选DNA条形码，通过PCR及测序成功率、K2P模型分析种内种间差异值(最理想的条形码片段是种内种间差异值没有重叠，即Barcoding Gap(NJ邻近归并法)树和ML(最大似然法)树的物种识别能力等方法评估以上基因片段是否适合作为圆盘菌无性型属的DNA条形码。指出SSU和mtLSU，即目前普遍认可的真菌条形码ITS则不能将该类真菌的物种完全区分开来。故本研究建议用RPB2或者RPB2+ITS联合片段作为圆盘菌属真菌无性型的DNA条形码。