禽传染性支气管炎病毒(IBV)分离鉴定、S1基因遗传进化研究

摘要

收集来自四川、重庆、湖北等14个规模化鸡场疑似感染禽传染性支气管炎病毒病料66份进行IBV分离鉴定,测定分离株S1基因序列并完成了遗传进化分析.结果共分离到19株IBV毒株.遗传进化分析发现,19个IBV分离毒株S1基因大小为1614～1626bp,S1基因序列相似性为77.8～99.8％,19个分离毒株S1基因型分别为A2-QX-LX4-1ike,SAIBK-like,TW2575/98-1ike等三种类型,而与现有疫苗毒株具有较远的遗传距离,提示我国应考虑使用新的与本地株亲缘关系较近的IBV毒株研发疫苗.建立基于1135条IBV毒株S1基因遗传进化分析发现,来自世界范围内1135条S1基因分为5个大群(ClusterⅠ-ClusterⅤ),其中ClusterⅠ以DE072为代表分布于美国.ClusterⅡ可分为2个亚群,其亚群1分布在澳大利亚,亚群2分布在中国及韩国日本等东亚地区.Cluster Ⅲ分布在澳大利亚,Cluster Ⅳ分布在中国.Cluster Ⅴ可分为18个亚群,18个亚群包含从最早分离到最近分离的IBV毒株,还包括从野鸡、野鸭等野生动物中所分离毒株,很好的显示了IBV进化的历史.本研究丰富了IB的分子流行病学数据,为IBV遗传进化及基因型特征的研究奠定了基础.