室间隔缺损患者循环miRNA表达差异研究

摘要

目的：先天性心脏病(CHD)是环境因素和遗传因素共同作用的结果.室间隔缺损(VSD)是CHD中最常见的一种.研究表明,microRNAs(miRNAs)与CHD的发生发展关系密切,但目前缺乏有关miRNAs与VSD的研究报道.本研究旨在通过血清差异miRNA的表达研究阐明miRNA与VSD发生发展的关系.rn 方法：采用miRNA表达谱芯片技术进行VSD患者血清miRNA表达差异分析,并对结果进行实时定量PCR(Real-time PCR)验证,进而对miRNA调控的靶基因进行生物信息学分析.rn 结果：通过miRNA芯片在VSD患者和对照血清样本中检测miRNA差异表达,筛选出36个表达差异的miRNA(P＜0.05),其中21个miRNA在VSD患者表达显著下调,15个表达显著上调.经过Real-time PCR验证,证实8个miRNAs差异表达有意义.通过生物信息学预测出447个靶基因,经GO分析富集度分值(Enrichment Score value)最大的生物过程(Biological process)为心脏右心室形态发生(cardiac right ventricle morphogenesis),对应的差异表达基因为NOTCH1、HAND1、ZFPM2和GATA3,调控这些基因的miRNA可能包括hsa-let-7e-5p、hsa-miR-222-3p和hsa-miR-433.rn 结论：通过微阵列技术分析和RT-PCR验证,筛选出8个差异表达miRNA,为后续实验提供了可供分析的miRNA.利用3个数据库及GO分析,发现hsa-let-7e-5p、hsa-miR-222-3p和hsa-miR-433的靶基因分别为NOTCH1、HAND1、ZFPM2和GATA3,为进一步在基因水平研究VSD的发病机制提供了新的突破口,为将来可能实现的基因诊断、基因干预治疗以及疾病的预防奠定了一定的实验基础.