猪繁殖与呼吸综合征病毒河北地方株GF11O7株ORF7基因的克隆与序列分析

摘要

根据GenBank公布的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ATCCVR2332株的核衣壳蛋白基因的核苷酸序列,设计并合成一对特异性引物.应用RT-PCR方法扩增猪繁殖与呼吸综合征病毒GF1107株(GenBank登陆号:AY684124)的ORF7片段.将扩增片段克隆入pMD18-T载体中获得含有相应片段的重组质粒pMDHB-ORF7.对质粒中的插入片段进行序列测定测序.应用DNAstar序列分析软件对所测序列与GenBank中PRRSV毒株进行同源性比较,结果表明,GF1107株的ORF7与美洲参考株ATCCVR2332的ORF7差异较小,核苷酸和氨基酸同源性分别为98.7﹪和96.7﹪;而与欧洲参考株LV株的差异性较大,核苷酸同源性为62.9﹪,氨基酸同源性为58.7﹪.