电子克隆结合RACE获取一个猪肉质新基因

摘要

溶酶体组织蛋白酶Dcathepsin-D(CTSD),是一个重要的溶酶体天冬氨酸蛋白酶,在溶酶体介导的细胞蛋白质降解过程中具有重要作用.本研究采用生物信息学、RT-PCR及RACE方法,分离测定了猪溶酶体组织蛋白酶CTSDcDNA全长序列,对该基因进行了序列分析.电子延伸得到1026bp的片段,3'RACE得到979bp片段,5'RACE得到284bp片段,拼接得到猪CTSD基因不含poly(A)的2032bp全长cDNA,其中5'端非翻译区有93bp,3'端非翻译区有706bp,开放阅读框(openreadingframe,ORF)1233bp.该序列与人CTSDcDNA序列同源性为80.2﹪,与鼠同源性为72.0﹪,主要差异在5'端非翻译区.