1株鹅源H5N1亚型禽流感病毒HA基因的序列分析

摘要

本研究对1株鹅源H5N1亚型禽流感病毒血凝素(HA)基因进行扩增、克隆,然后对毒株的HA基因阳性克隆鉴定、序列测定与分析.结果表明:所扩增的片段长1707bp,包含了完整的开放阅读框架,编码568个氨基酸.该毒株与A/chicken/Jilin/9/2004、A/goose/Guangdong/3/96和A/HongKong/156/97HA基因序列比较分析结果表明:核苷酸同源率分别为98.4％、97％和96.8％;氨基酸同源率分别为99.1％、97.2％和97％,受体结合位点的氨基酸均相同.该毒株有7个潜在糖基化位点;在HA裂解位点附近有6个碱性氨基酸序列插入.