应用适应性进化研究SARS病毒的起源问题

摘要

引发SARS世界流行的人类SARS病毒的起源问题一直受到广泛关注,本研究目的在于应用适应性进化研究方法来研究人类SARS病毒的起源问题,通过对SARS病毒Spike蛋白和N蛋白正选择位点的研究,来检验果子狸是否是人类SARS病毒的天然宿主.对人类SARS病毒Spike蛋白的研究发现3个正选择氨基酸,N蛋白发现1个正选择氨基酸,这些正选择氨基酸只出现在SARS病毒感染人类的早期病例中,而在中晚期病例都被选择掉了,因而可以看成是SARS病毒刚进入人体时的标志性氨基酸;其中而Spike蛋白75R和N蛋白25Ⅰ在果子狸SARS样病毒中没有出现,提示最初感染人类的SARS病毒可能不是直接来源于果子狸.同时果子狸SARS样病毒的Spike蛋白正选择压力位点与人类SARS病毒显著不同,提示果子狸的SARS样病毒在果子狸体内具有与人类完全不同的适应过程,它对于果子狸也可能是一种新感染病毒,因而不是SARS病毒的天然宿主.此适应性进化的研究结果支持2003/2004年SARS病例不是来源于人类SARS病毒的感染,而是由果子狸SARS样病毒感染而来的结论,也验证了通过本研究方法分析确定的正选择位点的正确性.上述研究表明:果子狸可能不是人类SARS病毒的天然宿主,但可以是中间宿主或保存宿主.