PF-2D蛋白质组初步定量方法结合cICAT-LC-MALDI-TOF-TOF精确定量方法的研究

摘要

定量蛋白质组学研究中常采用的研究策略既有在蛋白质水平上进行的定量比较(如基于2DE和DIGE的方法),也有肽段水平进行的定量方法(如以稳定同位素代谢标记为代表的生物标记和以同位素亲和标签(isotope coded affinity tages,ICAT)为代表的化学标记).尽管不同相对定量方法各有优缺点,但相比之下,ICAT方法能够兼容分析不同条件下获得的体液、细胞和组织中绝大部分蛋白质,所以应用更加广泛;另外,由于ICAT试剂仅标记含半胱氨酸残基的肽段,因此通过亲和提取,可以大大降低了蛋白质混合物的复杂性,并能很好地定量分析微量蛋白质.ICAT的基本原理即是把两种化学性质相同而质量不同的试剂(通常是含轻和重同位素标签的两种试剂)标记在不同来源的蛋白上,通过比较这两种同位素标签在质谱信号强度上的差异而得到不同来源的蛋白质的质量差异。