利用支持向量机预测HLA-A*0201结合多肽

摘要

主要组织相容性复合物(MHC)结合的抗原肽是免疫监督过程中的关键一步。大量的计算机方法应用于这一领域，并且已经取得了不错的预测结果。预测方法有motif法、以结构为基础的方法、机器统计学习的方法等，并达到预报准确率在70%～90%。生物统计主要集中在两个领域：生物序列编码和计算方法。过去研究大都着重在计算方法上，对编码方法的研究相对简单。本文在文献已有的四种编码方法进行计算的基础上，提出了一种新的基于HLA受体蛋白结合环境的编码方法，使模型的预报准确率和稳定性都得到了改进。