猪细小病毒vaccine株VP2基因克隆与抗原性分析

摘要

本研究参考GenBank公布的NADL-2株序列，设计出1对引物，并利用该引物扩增了猪细小病毒vaccine株VP2主要抗原基因，将其克隆到pGEM-T Easy载体上，测序获得656 bp核苷酸序列，并推导出其氨基酸序列，共编码218 aa，与NADL-2株相应的序列进行比较分析，比NADL-2毒株缺失781 bp，两者核苷酸同源性为98.9％，氨基酸同源性为97.2％;应用DNAstar软件对氨基酸的抗原表位进行了预测，共有七个抗原表位，分别在氨基酸N端的第10-18，34-39，94-103，121-126，137-144，156-165和209-214区段，此序列具有较好的免疫原性。