不同禽源新城疫病毒分离株F基因遗传变异分析

摘要

以鸡胚分离结合血清学鉴定，从近几年江苏省及河南省分离到来自鸡、鸽的6株新城疫病毒，病毒蚀斑纯化后，选取3个克隆利用RT-PCR技术扩增F基因重要功能区片段，在对PCR产物直接序列测定分析基础上，选取一致克隆株进行全长F基因克隆、序列测定分析。根据分离株序列与GenBank中NDV相关毒株序列比较分析结果，所分离的6个分离株归属为3个基因型：基因Ⅶd亚型(3株)；基因Ⅵ型(2株)；基因Ⅲ型(1株)。该6株NDV的F蛋白裂解位点的氨基酸序列为112R-R-Q-K-R-F117，为NDV强毒株典型序列。