2003～2008年湖南省猪圆环病毒2型分子流行研究

摘要

从2003年～2008年湖南省疑似PMWS病死猪组织中分离获得7株猪2型圆环病毒(PCV2),分别命名为：HuN-03、HuN-05、HuN-0601,HuN-0602、HuN-0701 HuN-0702、HuN-08。用PCR的方法对这7株病毒进行进行全基因扩增及测序分析,结果显示,7株PCV2分离株基因组全长均为1767nt,有典型的PCV2基因组结构;病毒毒株间同源性在94.9-99.3%之间,与Genbank中的13株PCV2基因组同源性在93.6-99.7%之间,与2株PCV1亲缘关系较远,同源性只有75.7-76.5%;在遗传演化关系上,7株分离株分属4个进化方向,HuN-0601可能是外来毒株,HuN-03在一个独立的进化方向内,可能是其它5株病毒的母源性毒株,其它5株病毒可能代表了两个遗传种群,一个是国际流行稳定毒株,一个是国内地域性流行毒株。