具有NADH脱氢酶功能的家蚕Bm-l(3)neo18基因的克隆与表达特征

摘要

果蝇l(3)neo18基因可以通过P转座子诱发致死突变，编码的蛋白质具有NADH脱氢酶（ND）的功能。利用生物信息学、RACE和RT-PCR等方法克隆了家蚕l(3)neo18同源基因，分析了基因结构与表达谱。Bm-l(3)neo18基因(EU826676)的cDNA全长为868bp，由573bp的完整开放读码框(ORF)序列、25bp的5′端非翻译区序列(5′UTR)和251bp的3′端非编码区序列(3′UTR)组成，编码蛋白质为190个氨基酸残基，分子量22.7kD，pI9.60。Bm-l(3)neo18基因由3个外显子和2个内含子组成，定位于家蚕第3染色体，位于nscaf2930的120.3knt-120.4knt。Bm-l(3)neo18蛋白质在1-185氨基酸残基位置为ND的SGDH亚基保守区，在61-83氨基酸残基位置具有一个保守的跨膜区域。采用ClustalW进行多序列比对发现，Bm-l(3)neo18与埃及伊蚊等昆虫ND具有50%以上的蛋白质同源性，ND的保守区域高度一致，NJ法分子进化分析也显示，Bm-l(3)neo18与昆虫ND进化上同源。该基因除在卵期的表达量较低外，在幼虫、蛹和蛾期均有较高表达，且存在组织差异性。