赤眼鳟线粒体NADH脱氢酶6基因克隆及序列特征分析

摘要

[目的]根据赤眼鳟线粒体NADH脱氢酶6(ND6)基因序列分析不同种鱼类的分子进化关系.[方法]根据其他鱼类的线粒体ND6基因及侧翼序列设计引物,采用PCR扩增并克隆、测序赤眼鳟ND6基因,通过MEGA 4.0 Neighbor-Joining法分析不同鱼类的进化关系.[结果]赤眼鳟(Squaliobarbus curriculus)线粒体基因组ND6基因序列长度为522 bp,编码173个氨基酸.该基因碱基组成为:A 41.5%、C 32.7%、G 12.4%、T 13.4%,其中A+ T含量(54.9%)高于G+ C 含量(45.1%).将赤眼鳟ND6基因序列与GenBank 中其他11种鱼类ND6基因序列进行比对发现,赤眼鳟ND6核酸序列与团头鲂的同源性最高,为90.8%;与红点鲑鱼的同源性最低,为73.0%.赤眼鳟ND6氨基酸序列与其他物种ND6氨基酸进行比对发现,赤眼鳟与团头鲂同源性最高,为98.3%;与大黄鱼的同源性最低,为75.7%.以ND6氨基酸序列采用NJ法构建12种鱼类的系统发生树基本反映了它们的种间、属间和科间的关系.[结论]首次得到了赤眼鳟线粒体ND6基因序列,并确定了赤眼鳟与其他11种鱼类的分子进化关系.