果蝇限食延缓衰老中的lncRNA表达谱分析

摘要

目的:饮食限制(限食)作为研究延缓衰老的重要手段之一,其作用机制尚不完全清楚.长非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)在多种生理学和病理学过程中发挥了重要作用,并参与了细胞衰老的调控.因此,本课题采用经典模式生物——果蝇为研究对象,分析限食延缓衰老过程中的lncRNA表达谱.rn 方法:运用illumina HiSeqTM2500平台高通量测定了果蝇在限食和不限食条件下第7天和第42天的转录组,再采用scripture和cufflinks软件拼接转录本lncRNA,同时运用HTSeq软件进行定量分析。rn 结果:共拼接到40,161条1ncRNA序列,其中包含了13,963条内含子长非编码RNA,22,103条反义长非编码RNA和23,988条长基因P7非编码RNA;同时,检测到40,161条lncRNA中有39,603条表达,但其表达水平普遍偏低。与不限食组果蝇对比,限食组的第7天有4条差异表达1ncRNA (p<0.05) ,第42天有1条lncRNA呈差异表达(p<0.05);限食组果蝇第7天和第42天对比,筛选到4条差异表达1ncRNA(p<0.05);不限食组的第7天和第42天对比,有3条lncRNA呈差异表达(p<0.05)。rn 结论:成功构建了果蝇限食和不限食条件下的lncRNA表达谱数据库,获得了可能参与限食延缓衰老中的差异表达lncRNA,其功能和作用机制有待进一步研究。

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