一株H9N2型禽流感病毒HA和NA基因的克隆和序列分析

摘要

试验采用RT-PCR技术，一次性扩增出一株禽流感病毒(H9N2型)HA和NA的全长基因，将片段克隆至pMD18-T载体进行测序，并与GenBank中参考株的相应基因进行比对及系统发育分析。结果表明，该毒株HA基因和NA基因的核苷酸序列和氨基酸序列均与A/chicken/Yokohama/aq45/2002同源性最近，且与疫苗株A/Chicken/Shanghai/F/98和NChicken/Guangdong/SS/94 HA基因和NA基因有较高的同源性。在系统进化发育树中处于A/Duck/Hong Kong/ Y280/97分支，属于欧亚系I群。HA基因裂解位点序列为P-A-R-S-S-R，这符合低致病性禽流感的分子特征。