2008-2009年间部分地区新城疫分离株的进化分析

摘要

目的：本研究旨在从分子水平上掌握我国新城疫的变异情况和流行规律。方法：研究汇集2008-2009年间从我国部分省市养殖场分离的9株新城疫毒株,采用RT-PCR技术对其F和HN基因进行扩增、克隆和测序,并对所得全序列进行同源性和遗传进化分析。结果：结果显示,9分离株有8株为基因Ⅶ型,1株为基因Ⅱ型,F基因开放性阅读框架(ORF)为1662bp,强毒株同La Sota的核苷酸同源性为83.5％～84.2％之间。HN基因基因开放性阅读框架(ORF)为1716bp和1734bp,强毒株在538位缺失一个糖基化位点。结论：结果表明,近年流行的ND疫情主要是由基因Ⅶ型NDV引起,F和HN基因的变异可能与频繁的疫苗免疫选择压力有关。