免疫相关EST-SSRs标记筛选及其在大菱鲆异源雌核发育子代遗传分析中的应用

摘要

对大菱鲆EST数据库中12434条序列进行微卫星搜索,共搜索出831条EST-SSR序列,从建立的大菱鲆EST-SSRs标记序列库中筛选出16条为明确标注免疫相关功能的基因序列.根据此16条EST-SSR序列设计引物,经过PCR扩增检测和反应条件的优化,最终筛选出9对扩增效果理想的EST-SSR标记对大菱鲆减数分裂雌核发育二倍体子代进行遗传变异检测,结果表明:在Scoph-2-1、Scoph-7-1、Scoph-10-1微卫星位点上大菱鲆亲本和雌核发育二倍体子代均为纯合基因型,其余6个微卫星位点(Psetta-1-1、Psetta-1-2、Psetta-3-1、Psetta-3-2、Scoph-4-1、Scoph-6-1)在大菱鲆雌核发育二倍体仔鱼群体中的观测杂合度≥0.70,期望杂合度＞0.46,平均期望杂合度为0.335.本项研究获得的9个免疫相关EST SSRs标记可有效地用于分析大菱鲆减数分裂雌核发育二倍体子代的遗传变异.这为研究雌核发育过程中免疫相关功能基因的重组和分离规律，以及今后通过分子生物学手段定向选育抗病、高产的大菱鲆优质品系奠定了基础。