中国小型猪SLA-DMA基因的SSCP分析

摘要

本研究通过对甘孜藏猪、合作猪、巴马猪以及五指山猪4个群体的SLA-DMA基因第2和第3外显子的PCR-SSCP和序列多态分析表明：SLA-DMA基因的第2外显子没有多态,但第3外显子有2个等位基因的变异。通过优化低离子强度单链构象多态分型条件(LIS-PCR-SSCP)、克隆测序、菌落PCR、菌落不对称PCR及单链DNA二级结构计算机预测等技术,对第3外显子广PCR-SSCP复杂带型进行了准确的判定,J等位基因的带型与单链DNA二级结构计算机预测结果之间存在很高的一致性。4群体中SLA-DMA基因的第3外显子共有JJ/JK/KK3种基因型,均达到了Hardy-Weinberg平衡。其中K等位基因频率高于J等位基冈频率。杂合度和多态信息含量的高低依次为：巴马猪、五指山猪、合作猪、甘孜藏猪。除甘孜藏猪多态信息含量为低度多态外,其余群体均为中度多态。