离散小波变换用于生物序列的相似性研究

摘要

该文将生物序列转化为数字序列,通过离散小波变换实现时域到频域的转化,设定阈值分别将各频域信号转化为字符串序列,根据最大公共子序列定义序列匹配度,并将其作为相似性的测度.结合不同频域层次序列的相似度全面考察生物序列的相似性.对蛋白质序列及基因编码序列的研究表明,该方法结合了小波分析与知识发现的优点,为生物序列相似性研究开辟了新的思路.