叶绿体DNA

摘要： 为了解闽南地区血叶兰种质资源的多样性,对8份血叶兰叶绿体DNA RPS16序列进行分析。结果表明,8份血叶兰种质资源的遗传距离范围在0~0.108之间,共136个多态位点,占总数的34%。利用MEGA7.0软件,基于K-2P遗传距离,采用邻接法构建系统进化树模型,将8份叶绿体DNARPS16分两个分支:S6和S1/S2/S3/S4/S5/S7/S8,应用clustalW对两两基因进行序列比对,一致性在78.69%~99.75%之间,表明血叶兰叶绿体DNA RPS16有着较大的变异。

摘要： 利用H-psbA与L-F 2个叶绿体DNA片段对来自贵州省遵义市湄潭县的老鹰茶古树种质资源进行遗传多样性分析。结果表明,与GenBank中的Actinodaphne lancifolia(登录号为NC_045251.1)相似值达100%,通过构建系统发育树发现该方法可以有效区分白芽株、红芽株、黄芽株,但不能有效区分雌雄性别。2个叶绿体DNA片段经测序、拼接、比对和合并之后片段长度为976 bp,共有41个多态性变异位点,其中包含28个单一突变位点、5个插入-缺失位点、11个简约信息位点。H-psbA与L-F区域的多态性变异位点数量分别为39个和2个,单倍型数分别为9个和2个,合并之后的叶绿体DNA片段的单倍型数为10个。核苷酸多样性与单倍型多样性较高区域为trnH-psbA(P_(i)=0.01892,H_(d)=0.978),较低区域为trnL-trnF(P_(i)=0.00212,H_(d)=0.467),10份老鹰茶植物植物2个叶绿体DNA区域合并后的遗传多样性较高(P_(i)=0.01126,H_(d)=1.000)。Tajima’s测验中,2个叶绿体DNA区域在各检验水平上均不显著,说明这2个叶绿体DNA区域在进化上遵循中性模型。

摘要： 黄缨菊(Xanthopappus subacaulis)是青藏高原地区一种特有的高山草甸药用植物。为探讨第四纪冰期气候波动对黄缨菊居群遗传结构和空间分布格局的影响,对黄缨菊20个居群、123个个体的叶绿体DNA片段(psbA-trnH、rbcL和psbI-psbK)进行测序和数据分析。结果表明:黄缨菊居群共检测到6个单倍型,其中H1为古老单倍型,除居群P7外其余居群均具有单倍型H1,H3、H5和H6为特有单倍型,单倍型H3为居群P7的私有单倍型,单倍型H5和H6只存在于居群P18,单倍型H2和H4主要存在于青海湖流域的居群;总的遗传多样性(H_(e))和核苷酸多样性(π)分别为3.101和0.008903;居群间遗传变异(68.98%)大于居群内遗传变异(31.02%),居群间遗传分化较高(F_(ST)=0.68985,P0.05),表明黄缨菊在分布区域内不存在明显的谱系地理结构;错配分布和中性检验结果显示,黄缨菊居群可能经历过近期扩张。据此,推测第四纪冰期黄缨菊可能在青海湖流域和甘肃临潭地区存在微型避难所,认为第四纪气候变迁及青藏高原隆升塑造了黄缨菊的现代地理分布格局。

摘要： 该文利用母系遗传的叶绿体DNA片段(psbA-trnH,psbI-psbK和psbJ-petA)对黄土高原地区的特有植物蕤核(Prinsepia uniflora)进行谱系地理学研究,以揭示其现有的遗传结构和群体历史动态.结果表明:(1)蕤核自然种群总的遗传多样性较高(HT=0.796),而种群内的遗传多样性较低(HS=0.276).(2)分子变异分析(AMOVA)表明,分布区域内蕤核具有较高的遗传分化(FST=0.674),且遗传变异主要存在于种群间(67.4％).(3)Mismatch分析和基于MaxEnt的不同历史时期生态位模拟结果表明,尽管蕤核的核心适生范围没有经历太大的变化,但其种群在最后一次大冰期结束后仍存在一定程度上的扩张.综上结果认为,与大多数分布在我国北方地区的许多植物类群一样,蕤核很可能是采取冰期在邻近或者就地避难,冰期过后局部回迁的方式应对第四纪的气候波动.

摘要： 目的 基于叶绿体基因联合序列分析不同地理居群黄精和多花黄精遗传多样性.方法 目的序列经PCR扩增、测序、拼接和比对后,DnaSP分析单倍型多态性,Permut计算遗传分化,Arlequin分析居群标准分子变异,最后构建基于遗传距离的系统发育树.结果 94条黄精序列存在2个多态性位点,得到3个单倍型,居群间总遗传多样性为0.142,居群内平均遗传多样性为0.018.26条多花黄精序列存在16个变异位点,得到6个单倍型,居群间总遗传多样性为0.857,居群内平均遗传多样性为0.435.结论 多花黄精比黄精表现出更高的遗传多样性.两个种群均有较高的遗传分化系数,种群变异主要来源于居群间,整个分布区不存在明显的分子谱系地理学结构.

摘要： 目的:通过分析rpl20-rps12、trnL-trnF及psbA-trnH序列变异特点,评价其对3种不同基原黄精的鉴定能力。方法:分别提取3种基原黄精总DNA,以rpl20-rps12、trnL-trnF及psbA-trnH引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增和测序。采用MEGA 5软件寻找其特异位点,计算样品K2-P(Kimura 2-parameter)遗传距离,并构建邻接(neighbor-joining,NJ)系统聚类树。结果:rpl20-rps12、trnL-trnF及psbA-trnH序列长度分别为722~737、293、457~531 bp,简约信息位点占比分别为0.4%、1.0%和2.4%。rpl20-rps12和psbA-trnH序列中种内最大遗传距离均小于种间最小遗传距离。基于3个序列构建的NJ树显示,3种基原黄精都表现出良好单系性,能明显区分。结论:从序列特点和种内、种间变异性综合分析,rpl20-rps12序列更适宜黄精的基原鉴定。

摘要： 利用叶绿体DNA标记对青藏高原地区青杨的14个野生居群开展谱系地理学研究,分析该区域青杨的遗传结构和居群动态,旨在揭示其在第四纪冰期的演化历史,为种质资源评价、遗传保护策略的制定等提供理论依据.提取青杨基因组DNA,cpDNA非编码区atpH-atpI和rbcL片段经扩增、检测、纯化和测序后获得序列,统计cpDNA联合序列的变异位点并确定了13个单倍型;分子变异分析显示青杨的遗传变异主要存在于居群间而非居群内;研究范围内青杨单倍型之间不存在谱系地理关系,且歧点分布分析和中性检测均未检测到青杨发生过近期居群扩张.青杨的遗传分布和地理分布之间没有显著相关性,可能是由于在研究区域内存在多个微型避难所所致,如祁连山脉和横断山脉地区就可能为青杨的冰期微型避难所,而这些区域也是冰期后居群回迁和扩散的发源中心.

摘要： 亚洲栽培稻分为籼稻(hsien或indica)和粳稻(keng或japonica)两个亚种。基于籼-粳稻叶绿体DNA(cpDNA)的PstⅠ-12片段ORF100区域的序列差异,即籼稻cpDNA的ORF100区域缺失69 bp的碱基片段,建立籼-粳稻亚种鉴定方法。本文选择典型的籼稻谷(米)样品(台籼11号)和粳稻谷(米)(东北珍珠大米)进行叶绿体DNA(cpDNA)PstⅠ-12片段的ORF100区域DNA的SYBR-Green实时荧光PCR扩增和测序,在籼-粳稻2个PCR产物序列比对的基础上,设计正向引物4条(F1-F4)、反向引物3条(R1-R3),组合成12对引物进行优化筛选,选出F4R1引物对。在粳稻样品中,检出cpDNA PCR产物片段长度为204 bp(非缺失型),荧光PCR扩增熔解温度Tm值为78.00;在籼稻样品中,检出cpDNA PCR产物片段长度为135 bp(cpDNA缺失型),荧光PCR扩增熔解温度Tm值为76.50。建立了籼-粳稻亚种SYBR-Green实时荧光PCR鉴定方法。基于上述实验结果,选择国内多个省份的典型籼/粳稻品种与籼/粳型杂交稻组合共538个,对该籼粳稻米亚种鉴定方法进行验证。在177个粳稻及粳型杂交组合样品中,cpDNA荧光PCR熔解温度Tm值为78.00的样品170个,与粳稻符合率为96.05%,Tm值为76.50的7个样品,不符合率为3.95%;在361个籼稻及籼型杂交稻样品中,Tm值为76.50的样品331个,与籼稻符合率为91.69%,Tm值为78.00的30个样品,不符合率为8.31%。本方法只检测一个遗传稳定的细胞质叶绿体DNA位点,用于籼-粳稻米的亚种鉴定,简便高效,准确率高。

摘要： 在植物基因组中,叶绿体DNA(cpDNA)序列可以向核基因组转移成为核质体DNA(NUPT).NUPTs在植物染色体包括性染色体的演化过程中可能具有重要的作用,但目前该方面的研究比较少.本研究以雌雄异株植物石刁柏(Asparagus officinalis)为材料,采用生物信息学方法对其核基因组NUPTs进行注释及分析,并选取叶绿体基因组反向重复区(IR)两个片段进行染色体定位分析.结果表明:石刁柏核基因组中共有2,239个NUPTs序列的插入,总长度为565,970bp,占核基因组的0.047％.不同染色体上插入的NUPTs数量存在较大差异,Y染色体上的NUPTs数量、密度及总长度均高于其他染色体,表明NUPTs在石刁柏Y染色体上具有更多的累积.石刁柏叶绿体基因组中的IR、SSC和LSC区均能够向核基因组转移,但IR区序列转移频率更高.另外,对两个IR区的叶绿体序列进行荧光原位杂交,其中AocpIR1主要分布在所有染色体的着丝粒部位,而AocpIR2特异分布在Y染色体上.本研究为深入理解石刁柏基因组的结构及其性染色体的演化奠定了坚实的基础.

摘要： 在植物基因组中,叶绿体DNA(cpDNA)序列可以向核基因组转移成为核质体DNA(NUPT).NUPTs在植物染色体包括性染色体的演化过程中可能具有重要的作用,但目前该方面的研究比较少.本研究以雌雄异株植物石刁柏(Asparagus officinalis)为材料,采用生物信息学方法对其核基因组NUPTs进行注释及分析,并选取叶绿体基因组反向重复区(IR)两个片段进行染色体定位分析.结果表明:石刁柏核基因组中共有2,239个NUPTs序列的插入,总长度为565,970bp,占核基因组的0.047％.不同染色体上插入的NUPTs数量存在较大差异,Y染色体上的NUPTs数量、密度及总长度均高于其他染色体,表明NUPTs在石刁柏Y染色体上具有更多的累积.石刁柏叶绿体基因组中的IR、SSC和LSC区均能够向核基因组转移,但IR区序列转移频率更高.另外,对两个IR区的叶绿体序列进行荧光原位杂交,其中AocpIR1主要分布在所有染色体的着丝粒部位,而AocpIR2特异分布在Y染色体上.本研究为深入理解石刁柏基因组的结构及其性染色体的演化奠定了坚实的基础.

摘要： 在植物基因组中,叶绿体DNA(cpDNA)序列可以向核基因组转移成为核质体DNA(NUPT).NUPTs在植物染色体包括性染色体的演化过程中可能具有重要的作用,但目前该方面的研究比较少.本研究以雌雄异株植物石刁柏(Asparagus officinalis)为材料,采用生物信息学方法对其核基因组NUPTs进行注释及分析,并选取叶绿体基因组反向重复区(IR)两个片段进行染色体定位分析.结果表明:石刁柏核基因组中共有2,239个NUPTs序列的插入,总长度为565,970bp,占核基因组的0.047％.不同染色体上插入的NUPTs数量存在较大差异,Y染色体上的NUPTs数量、密度及总长度均高于其他染色体,表明NUPTs在石刁柏Y染色体上具有更多的累积.石刁柏叶绿体基因组中的IR、SSC和LSC区均能够向核基因组转移,但IR区序列转移频率更高.另外,对两个IR区的叶绿体序列进行荧光原位杂交,其中AocpIR1主要分布在所有染色体的着丝粒部位,而AocpIR2特异分布在Y染色体上.本研究为深入理解石刁柏基因组的结构及其性染色体的演化奠定了坚实的基础.

摘要： 在植物基因组中,叶绿体DNA(cpDNA)序列可以向核基因组转移成为核质体DNA(NUPT).NUPTs在植物染色体包括性染色体的演化过程中可能具有重要的作用,但目前该方面的研究比较少.本研究以雌雄异株植物石刁柏(Asparagus officinalis)为材料,采用生物信息学方法对其核基因组NUPTs进行注释及分析,并选取叶绿体基因组反向重复区(IR)两个片段进行染色体定位分析.结果表明:石刁柏核基因组中共有2,239个NUPTs序列的插入,总长度为565,970bp,占核基因组的0.047％.不同染色体上插入的NUPTs数量存在较大差异,Y染色体上的NUPTs数量、密度及总长度均高于其他染色体,表明NUPTs在石刁柏Y染色体上具有更多的累积.石刁柏叶绿体基因组中的IR、SSC和LSC区均能够向核基因组转移,但IR区序列转移频率更高.另外,对两个IR区的叶绿体序列进行荧光原位杂交,其中AocpIR1主要分布在所有染色体的着丝粒部位,而AocpIR2特异分布在Y染色体上.本研究为深入理解石刁柏基因组的结构及其性染色体的演化奠定了坚实的基础.

摘要： 为研究红麻叶片叶绿体DNA(cpDNA)的非编码区的序列特征,本文采用改良CTAB方法提取红麻总DNA,以8份红麻光钝感突变体及其4份近缘种基因组DNA为材料,应用8对植物cpDNA通用引物对红麻叶绿体基因组非编码区DNA序列进行PCR扩增,结果表明:所筛选通用引物适合于红麻cpDNA非编码序列扩增引物,可在红麻光钝感突变体与正常品种均能扩增出条带,扩增产物经1.5％琼脂糖电泳检测,片段大小在0.4kb-2.0Kb之间,共扩增cpDNA片段大小约13kb.将PCR扩增产物进行酶切,每个片段均有相同的酶切位点,但在cp4引物的PCR扩增产物用AluⅠ酶切获得多态片段,红麻光钝感突变体及其对照的cpDNA存在部分变异,为进一步探讨红麻光钝感突变体与叶绿体基因组变异之间的关系研究提供理论依据.

摘要： 为研究红麻叶片叶绿体DNA(cpDNA)的非编码区的序列特征,本文采用改良CTAB方法提取红麻总DNA,以8份红麻光钝感突变体及其4份近缘种基因组DNA为材料,应用8对植物cpDNA通用引物对红麻叶绿体基因组非编码区DNA序列进行PCR扩增,结果表明:所筛选通用引物适合于红麻cpDNA非编码序列扩增引物,可在红麻光钝感突变体与正常品种均能扩增出条带,扩增产物经1.5％琼脂糖电泳检测,片段大小在0.4kb-2.0Kb之间,共扩增cpDNA片段大小约13kb.将PCR扩增产物进行酶切,每个片段均有相同的酶切位点,但在cp4引物的PCR扩增产物用AluⅠ酶切获得多态片段,红麻光钝感突变体及其对照的cpDNA存在部分变异,为进一步探讨红麻光钝感突变体与叶绿体基因组变异之间的关系研究提供理论依据.

摘要： 为研究红麻叶片叶绿体DNA(cpDNA)的非编码区的序列特征,本文采用改良CTAB方法提取红麻总DNA,以8份红麻光钝感突变体及其4份近缘种基因组DNA为材料,应用8对植物cpDNA通用引物对红麻叶绿体基因组非编码区DNA序列进行PCR扩增,结果表明:所筛选通用引物适合于红麻cpDNA非编码序列扩增引物,可在红麻光钝感突变体与正常品种均能扩增出条带,扩增产物经1.5％琼脂糖电泳检测,片段大小在0.4kb-2.0Kb之间,共扩增cpDNA片段大小约13kb.将PCR扩增产物进行酶切,每个片段均有相同的酶切位点,但在cp4引物的PCR扩增产物用AluⅠ酶切获得多态片段,红麻光钝感突变体及其对照的cpDNA存在部分变异,为进一步探讨红麻光钝感突变体与叶绿体基因组变异之间的关系研究提供理论依据.

摘要： 为研究红麻叶片叶绿体DNA(cpDNA)的非编码区的序列特征,本文采用改良CTAB方法提取红麻总DNA,以8份红麻光钝感突变体及其4份近缘种基因组DNA为材料,应用8对植物cpDNA通用引物对红麻叶绿体基因组非编码区DNA序列进行PCR扩增,结果表明:所筛选通用引物适合于红麻cpDNA非编码序列扩增引物,可在红麻光钝感突变体与正常品种均能扩增出条带,扩增产物经1.5％琼脂糖电泳检测,片段大小在0.4kb-2.0Kb之间,共扩增cpDNA片段大小约13kb.将PCR扩增产物进行酶切,每个片段均有相同的酶切位点,但在cp4引物的PCR扩增产物用AluⅠ酶切获得多态片段,红麻光钝感突变体及其对照的cpDNA存在部分变异,为进一步探讨红麻光钝感突变体与叶绿体基因组变异之间的关系研究提供理论依据.

摘要： 以不同地区的13株叶籽银杏为研究对象,通过克隆测序的方法测得其trnS-G序列并进行比较分析.结果表明,大部分序列长度为1005bp,采自山东省沂源的YZ4序列最短,为1002bp,叶籽银杏的trnS-G序列富含A/T,G+C含量平均为37.7％.排序后在全序列范围内,可变位点有16个,包括信息位点1个,13株叶籽银杏trnS-G序列之间具有高度同源性.选取YZ1序列进行Blast检验后发现叶籽银杏trnS-G序列与银杏的相似度最高.叶籽银杏trnS-G序列测定与分析为其系统发育和分类地位的研究奠定了基础.

摘要： 以不同地区的13株叶籽银杏为研究对象,通过克隆测序的方法测得其trnS-G序列并进行比较分析.结果表明,大部分序列长度为1005bp,采自山东省沂源的YZ4序列最短,为1002bp,叶籽银杏的trnS-G序列富含A/T,G+C含量平均为37.7％.排序后在全序列范围内,可变位点有16个,包括信息位点1个,13株叶籽银杏trnS-G序列之间具有高度同源性.选取YZ1序列进行Blast检验后发现叶籽银杏trnS-G序列与银杏的相似度最高.叶籽银杏trnS-G序列测定与分析为其系统发育和分类地位的研究奠定了基础.

摘要： 本发明提供了一种向莴苣叶绿体中导入外源DNA的方法，包括：利用SEQ ID NO：2所示序列或者包括SEQ ID NO：2所示序列3’端的不小于1kb的片段、SEQ ID NO：3所示序列或者包括SEQ ID NO：3所示序列5，端的不小于1kb的片段、外源DNA片段以及一种载体质粒来构建一个重组载体质粒，并使插入到载体质粒上的外源DNA片段位于所述的两个片段之间；利用所构建的重组载体质粒DNA转化莴苣细胞；培养转化的细胞成为植株。本发明还提供了用于该方法的莴苣叶绿体DNA片段。

摘要： 本发明涉及生物基因工程技术领域，具体的说是一种向微拟球藻叶绿体中导入外源DNA的方法及相关的叶绿体基因组序列。基因序列包括SEQID NO:1所示的序列、SEQ ID NO:2所示的序列以及插入两者之间的外源基因。具体方法通过电穿孔法将包括SEQ ID NO:1所示的序列、SEQ ID NO:2所示的序列以及插入两者之间的外源基因的叶绿体转化载体导入微拟球藻细胞。本发明提供了根据七株微拟球藻叶绿体基因组之间的保守基因以及微拟球藻叶绿体和硅藻或褐藻叶绿体基因组的保守基因，可以用于设计构建在微拟球藻中通用的叶绿体遗传改造体系以及多个种属单细胞微藻通用的叶绿体遗传改造体系。

摘要： 本发明公开一种葱属主要蔬菜作物叶绿体DNA提取方法及其质量评价体系的建立，通过采用试剂优化后的高盐低pH值法，与蔗糖DNase法对比，对他们进行叶绿体DNA提取测试，结果表明，高盐低pH法优于蔗糖DNase法。此外，通过叶绿体DNA含量的荧光定量比值评价体系，评估了高盐低pH法和蔗糖DNase法对大葱叶绿体DNA含量提取效果，随后我们用高盐低pH法对葱属蔬菜作物的洋葱、大蒜和韭菜进行了测试，获得了预期的效果。本发明的DNA提取方法DNA产率高；纯度高，没有多糖、蛋白质等杂质的污染；叶绿体DNA的含量高，为进一步提取无核污染的高纯度叶绿体DNA以及细胞器全基因组测序奠定了基础。

摘要： 本发明提供了一种向莴苣叶绿体中导入外源DNA的方法，包括：利用SEQ ID NO：2所示序列或者包括SEQ ID NO：2所示序列3’端的不小于1kb的片段、SEQ ID NO：3所示序列或者包括SEQ ID NO：3所示序列5’端的不小于1kb的片段、外源DNA片段以及一种载体质粒来构建一个重组载体质粒，并使插入到载体质粒上的外源DNA片段位于所述的两个片段之间；利用所构建的重组载体质粒DNA转化莴苣细胞；培养转化的细胞成为植株。本发明还提供了用于该方法的莴苣叶绿体DNA片段。

摘要： 本发明涉及生物基因工程技术领域，具体的说是一种向微拟球藻叶绿体中导入外源DNA的方法及相关的叶绿体基因组序列。基因序列包括SEQID NO:1所示的序列、SEQ ID NO:2所示的序列以及插入两者之间的外源基因。具体方法通过电穿孔法将包括SEQ ID NO:1所示的序列、SEQ ID NO:2所示的序列以及插入两者之间的外源基因的叶绿体转化载体导入微拟球藻细胞。本发明提供了根据七株微拟球藻叶绿体基因组之间的保守基因以及微拟球藻叶绿体和硅藻或褐藻叶绿体基因组的保守基因，可以用于设计构建在微拟球藻中通用的叶绿体遗传改造体系以及多个种属单细胞微藻通用的叶绿体遗传改造体系。

摘要： 本发明公开了改良高盐‑低pH法提取灯盏细辛叶绿体基因组DNA的方法。本发明方法，包括如下步骤：(1)将经饥饿处理的灯盏细辛叶片加入缓冲液A中进行匀浆，过滤，收集滤液；对滤液进行第一次离心，收集上清液；对上清液进行第二次离心，收集绿色沉淀，得到粗叶绿体；(2)在步骤(1)得到的粗叶绿体中加入缓冲液B，轻悬，离心，收集沉淀，得到叶绿体；(3)在步骤(2)得到的叶绿体中加入缓冲液C，再加入蛋白酶进行温育，冷却；(4)从步骤(3)裂解后的体系中提取叶绿体DNA，得到叶绿体基因组DNA。本发明方法可简单、快速获取完整的叶绿体及叶绿体DNA，所得DNA结构完整、质量高、纯度好，未出现降解现象，能够满足后续测序工作的标准和要求。

摘要： 本发明涉及分子生物学领域，具体涉及12个华东木犀物种的特异性叶绿体基因变异位点，利用本发明提供的用于特异性叶绿体基因变异位点鉴定的DNA探针，可以将华东木犀和其他木犀属物种区分开，从叶绿体基因组水平上挖掘华东木犀的特异性叶绿体基因变异位点，将为华东木犀的起源和进化提供新的分子证据，以期为华东木犀的barcode研究提供可靠信息。

摘要： 本发明提供一种基于叶绿体DNA序列差异的籼‑粳亚种稻米种类二重实时荧光PCR快速鉴别方法。在已公开的一对引物基础上，设计了1条探针5′‑HEX‑ATG CAA TAG AGA GCG AGT GG‑BHQ1‑3′，利用已发布的标准中的水稻内源gos9基因的实时荧光PCR检测用的引物与探针，建立了籼‑粳亚种稻米的二重实时荧光PCR鉴别方法，cpDNA缺失型的籼稻的PCR扩增结果只出现水稻内源gos9基因的1条荧光扩增曲线，cpDNA非缺失型的粳稻的PCR扩增结果同时出现水稻内源gos9基因与粳稻特异性cpDNA的2条荧光扩增曲线，该曲线差异用于有效鉴别待测稻米所属的种类。

摘要： 本发明提供一种基于叶绿体DNA序列差异的籼粳稻米种类荧光PCR快速检测鉴定方法。以正向引物F4：3’‑AATCGCAACCCCTTTCCGC‑5’，反向引物R1：3’‑TTGAGGATTATTCCATGATTCC‑5’，建立了籼‑粳稻米叶绿体DNA SYBR Green荧光PCR检测方法，PCR扩增产物籼稻为135 bp、粳稻为204 bp片段，2种稻米的SYBR Green荧光PCR扩增熔解温度（Tm）为：籼稻Tm值为76.5°C，粳稻Tm值为78.0°C，二者Tm值差为1.5。该熔解温度（Tm）的差别，用于判别鉴定待测稻米所属的种类。

摘要： 本发明属于分子生物学技术领域，特别涉及一种叶绿体DNA的富集方法。本发明的方法基于植物细胞中的叶绿体DNA与细胞核DNA甲基化位点存在的差异，利用带有蛋白A修饰的磁珠，通过MBD2‑Fc蛋白媒介，将植物基因组DNA中的细胞核DNA和叶绿体DNA进行分离，并进一步实现对叶绿体DNA的富集。利用本发明的方法，在测序前进行叶绿体DNA的富集，然后对富集后的叶绿体DNA进行测序，可有效提高测序数据中叶绿体DNA序列的比例，显著提高测序的准确度、降低测序成本。