本发明提供一种基于叶绿体DNA序列差异的籼‑粳亚种稻米种类二重实时荧光PCR快速鉴别方法。在已公开的一对引物基础上,设计了1条探针5′‑HEX‑ATG CAA TAG AGA GCG AGT GG‑BHQ1‑3′,利用已发布的标准中的水稻内源gos9基因的实时荧光PCR检测用的引物与探针,建立了籼‑粳亚种稻米的二重实时荧光PCR鉴别方法,cpDNA缺失型的籼稻的PCR扩增结果只出现水稻内源gos9基因的1条荧光扩增曲线,cpDNA非缺失型的粳稻的PCR扩增结果同时出现水稻内源gos9基因与粳稻特异性cpDNA的2条荧光扩增曲线,该曲线差异用于有效鉴别待测稻米所属的种类。
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