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Nucleotide sequence search method and nucleotide sequence retrieval device

机译:核苷酸序列检索方法和核苷酸序列检索装置

摘要

In designing the nucleotide sequences, such as siRNA, to provide such apparatus and method for fast searching without omission gene comprising a nucleotide sequence similar. To this end, and as a remainder a partial sequence thereof, the Hamming distance is the number of bases to identify a portion of the remaining partial sequences of two of a predetermined length from the base sequence is entered, the corresponding incompatible The allocation can be divided into a portion of, among the partial sequences of the two, by selecting the more allocated number is not large, and to perform the search.
机译:在设计核苷酸序列,例如siRNA时,提供了用于快速搜索而没有包含相似核苷酸序列的遗漏基因的装置和方法。为此,作为剩余的部分序列,汉明距离是从碱基序列中识别出预定长度的两个剩余部分序列的一部分的碱基数,相应的不兼容通过选择更多分配的数目不大的部分序列中的一部分,在两个的部分序列中进行搜索。

著录项

  • 公开/公告号JPWO2005096208A1

    专利类型

  • 公开/公告日2008-02-21

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 株式会社バイオシンクタンク;

    申请/专利号JP20060511830

  • 发明设计人 森下 真一;山田 智之;

    申请日2005-03-31

  • 分类号G06F19/00;G06F17/30;C12N15/09;

  • 国家 JP

  • 入库时间 2022-08-21 20:17:00

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