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Determination of melting temperatures by equation-less methods

机译:用无方程式方法测定熔融温度

摘要

Numerical determinations of the first derivatives of a melt curve data set are made. A baseline is determined for the first derivative values and the baseline is subtracted from the first derivative values to produce modified first derivative values. A first maximum value of the modified first derivative values is determined and said first maximum value represents a melting temperature Tm of a DNA sample. A model function, such as a Gaussian Mixture Model (GMM) function, with parameters determined using a Levenberg-Marquardt (LM) regression process can also be used to find an approximation to the first derivative curve. The maximum values of the numerically determined first derivative values are used as initial conditions for parameters of the model function. The determined parameters provide one or more fractional melting temperature values, which can be returned, for example, displayed or otherwise used for further processing.
机译:进行熔体曲线数据集的一阶导数的数值确定。确定一阶导数值的基线,并从一阶导数值中减去该基线以产生修改后的一阶导数值。确定修改后的一阶导数值的第一最大值,并且所述第一最大值代表DNA样品的解链温度Tm。还可以使用具有使用Levenberg-Marquardt(LM)回归过程确定的参数的模型函数(例如高斯混合模型(GMM)函数)来查找一阶导数曲线的近似值。数值确定的一阶导数值的最大值用作模型函数参数的初始条件。所确定的参数提供一个或多个分数熔化温度值,这些值可以返回例如显示,或以其他方式用于进一步处理。

著录项

  • 公开/公告号EP2180418A3

    专利类型

  • 公开/公告日2017-11-08

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 ROCHE DIAGNOSTICS GMBH;F. HOFFMANN-LA ROCHE AG;

    申请/专利号EP20090012959

  • 发明设计人 KURNIK RONALD T.;

    申请日2009-10-14

  • 分类号G06F17/10;C12Q1/68;G06K9;G06F17/18;

  • 国家 EP

  • 入库时间 2022-08-21 14:07:40

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