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COMPUTATIONAL PHYLOGENETIC ANALYSIS

机译:计算系统发育分析

摘要

Systems and a method for computationally analyzing genetic base pairs are provided. In one or more aspects, a system includes a memory and a processor coupled to the memory. The processor is configured to receive a number of genetic sequences from a genetic sequencer device. The processor can generate, for each genetic sequence, a binary sequence. Each binary sequence is partitioned into a set of binary strings. Each binary string includes multiple binary base pairs. A set of entropy values are determined, each entropy value is associated with a binary string, and an entropy distribution function (EDF) is generated based on the set of entropy values.
机译:提供了用于对遗传碱基对进行计算分析的系统和方法。在一个或多个方面,一种系统包括存储器和耦合到该存储器的处理器。处理器被配置为从遗传测序仪设备接收许多遗传序列。处理器可以为每个遗传序列生成一个二进制序列。每个二进制序列被划分为一组二进制字符串。每个二进制字符串包括多个二进制碱基对。确定一组熵值,每个熵值与一个二进制字符串相关联,并基于该组熵值生成一个熵分布函数(EDF)。

著录项

  • 公开/公告号US2019078156A1

    专利类型

  • 公开/公告日2019-03-14

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 COLOSSIO INC.;

    申请/专利号US201715704157

  • 发明设计人 JOSEPH A. JAROCH;

    申请日2017-09-14

  • 分类号C12Q1/68;G06F19/14;G06F19/18;G06F19/22;G06F19/24;

  • 国家 US

  • 入库时间 2022-08-21 12:08:17

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