СПОСІБ ЗАСТОСУВАННЯ СИСТЕМИ МОНІТОРИНГУ З БАЗАМИ ДАНИХ ТА КЛЮЧАМИ У ВИГЛЯДІ ЗОБРАЖЕНЬ ГЕНЕТИЧНИХ КОДІВ РИБ, ІНШИХ ВОДНИХ ОРГАНІЗМІВ

摘要

Спосіб застосування біотехнічної мережевої комп'ютеризованої системи для моніторингу з базами даних (БТСМ-БД), що містить ряд підсистем; принаймні один датчик - біосенсор (біосенсорна тест-система - БТС), який має частини: механогідравлічну з біологічним фрагментом (БФ), електричну та комп'ютерну й дозволяє реєстрацію отриманих даних, їх процесинг, аналіз та вивід даних щодо дії хімічних речовин. Процес реєстрації відбувається у послідовності: хімічну речовину наносять на БФ, на якому після дії агоніста реєструють електричний сигнал; вимірюють зміни електричних іонних трансмембранних сигналів від БФ. Дія речовин вимірюється у кількісних одиницях з використанням методів patch-clamp, voltage-clamp та інших подібних. БФ у біосенсорі БТС проходить попередню обробку за спеціально розробленими процедурами, в т.ч. обробку ферментами у розчинах зі спеціально підібраним складом; температурними та часовими режимами обробки; наступним видаленням залишків ферменту та відновленням складу зовнішньоклітинного розчину. Застосовують метод фіксації концентрації (concentration-clamp) та удосконалюють реєстрацію вихідного електричного сигналу, покращуючи для нього співвідношення сигнал/шум та суттєво знизивши сам рівень шумів. БФ виконують роль первинної ланки у біосенсорі-біодетекторі та/або біоаналізаторі діючих речовин, а електричні сигнали з них надходять на вхід комп'ютерів у мережі системи БТСМ-БД. БТС поєднують з інформаційною системою, за допомогою якої виконують збір даних з пристроїв, на які надходять електричні сигнали від біосенсорів, також у інформаційну систему включають засоби декодування даних, їх систематизації, сховище даних різних рівнів обробки, базу метаданих для швидкого пошуку даних в сховищі та Web-інтерфейс. При створенні баз даних риб та інших водних організмів як ключі (у тому числі первинні ключі) застосовують генетичні коди-послідовності нуклеотидів цих організмів, що виражені у вигляді відцифрованих зображень, отриманих дослідним шляхом з набором-послідовністю смуг, штрихів та/або плям різної форми. БФ обробляють ферментами A.oryzae або комплексом пронази з колагеназою.