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一种基于联合似然的孟德尔随机化分析方法

摘要

本发明涉及疾病分析领域,具体提供了一种基于联合似然的孟德尔随机化分析方法,其可以同时对一组相互之间处于高LD(linkage disequilibrium,连锁不平衡)的初始候选SNPs(Single Nucleotide Polymorphism,单核苷酸多态性)工具变量进行建模,从中自动筛选合适的工具变量进行孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)分析,对在生物遗传中普遍存在的两种类型的水平多效性进行判别,并进行良好的控制,另外结合可扩展的抽样算法可以给出校准的p值,发明人将该方法称为工具变量自动筛选的两样本孟德尔随机化(MRAID)。发明人通过全面的模拟来证明MRAID的有效性,并且可以用于生物库大规模数据的实证分析,计算效率高,因此具有良好的实际应用价值。

著录项

  • 公开/公告号CN114171110B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022.12.20

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 山东大学;

    申请/专利号CN202111219537.3

  • 发明设计人 袁中尚;燕冉;刘璐;郭萍;薛付忠;

    申请日2021.10.20

  • 分类号G16B5/20;G16B20/20;

  • 代理机构北京圣州专利代理事务所(普通合伙);

  • 代理人王宇航

  • 地址 250102 山东省济南市历下区文化西路44号

  • 入库时间 2023-01-09 21:32:12

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